Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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