Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms