Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 AL391845.2-201ENST00000443930 1954 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 CELF3-202ENST00000290585 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 LDLR-203ENST00000535915 2768 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 C1orf216-201ENST00000270815 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 HPSE2-201ENST00000370546 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 NTM-206ENST00000427481 2583 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 ABLIM3-203ENST00000356541 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 ABLIM3-211ENST00000517451 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MYRIPQ8NFW9 ARHGEF9-203ENST00000374872 2364 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 BCDIN3D-AS1-201ENST00000548872 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 FAM105A-201ENST00000274217 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 TRO-202ENST00000319167 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 TRO-203ENST00000375022 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 RGPD5-203ENST00000393283 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 ABCB9-211ENST00000540285 3330 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 ZIC3-201ENST00000287538 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 AC138150.2-201ENST00000589796 2053 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 CSAD-201ENST00000267085 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 KLK2-202ENST00000358049 2847 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 RBM4-205ENST00000409406 2321 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 ALOXE3-201ENST00000318227 3053 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 GDPD5-202ENST00000443276 3106 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MYRIPQ8NFW9 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms