Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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ZNF397Q8NF99 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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ZNF397Q8NF99 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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ZNF397Q8NF99 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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ZNF397Q8NF99 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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ZNF397Q8NF99 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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ZNF397Q8NF99 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ZNF397Q8NF99 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ZNF397Q8NF99 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ZNF397Q8NF99 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ZNF397Q8NF99 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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