Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMIM5Q71RC9 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM5Q71RC9 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM5Q71RC9 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM5Q71RC9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM5Q71RC9 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM5Q71RC9 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM5Q71RC9 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms