Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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