Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q6P435 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q6P435 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q6P435 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q6P435 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q6P435 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q6P435 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q6P435 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q6P435 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q6P435 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q6P435 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q6P435 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q6P435 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q6P435 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q6P435 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q6P435 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q6P435 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q6P435 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q6P435 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q6P435 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q6P435 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q6P435 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q6P435 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q6P435 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q6P435 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q6P435 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q6P435 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q6P435 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q6P435 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q6P435 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q6P435 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q6P435 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q6P435 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q6P435 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q6P435 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q6P435 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q6P435 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q6P435 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Q6P435 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q6P435 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q6P435 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q6P435 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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