Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUD6

FAM69B, Protein FAM69B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69BQ5VUD6 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM69BQ5VUD6 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FAM69BQ5VUD6 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM69BQ5VUD6 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms