Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SKOR2Q2VWA4 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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