Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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