Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRB1P82279 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRB1P82279 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CRB1P82279 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRB1P82279 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRB1P82279 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRB1P82279 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRB1P82279 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRB1P82279 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRB1P82279 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRB1P82279 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRB1P82279 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRB1P82279 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRB1P82279 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRB1P82279 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CRB1P82279 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRB1P82279 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRB1P82279 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CRB1P82279 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRB1P82279 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CRB1P82279 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRB1P82279 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRB1P82279 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRB1P82279 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CRB1P82279 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CRB1P82279 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRB1P82279 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRB1P82279 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRB1P82279 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CRB1P82279 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CRB1P82279 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CRB1P82279 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRB1P82279 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRB1P82279 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRB1P82279 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRB1P82279 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRB1P82279 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRB1P82279 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRB1P82279 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRB1P82279 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRB1P82279 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRB1P82279 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRB1P82279 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CRB1P82279 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRB1P82279 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CRB1P82279 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CRB1P82279 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CRB1P82279 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRB1P82279 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRB1P82279 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRB1P82279 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRB1P82279 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRB1P82279 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRB1P82279 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRB1P82279 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRB1P82279 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRB1P82279 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRB1P82279 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRB1P82279 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRB1P82279 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CRB1P82279 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRB1P82279 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms