Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SKP1P63208 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SKP1P63208 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SKP1P63208 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SKP1P63208 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SKP1P63208 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SKP1P63208 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SKP1P63208 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SKP1P63208 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SKP1P63208 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SKP1P63208 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SKP1P63208 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SKP1P63208 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SKP1P63208 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SKP1P63208 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SKP1P63208 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SKP1P63208 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SKP1P63208 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SKP1P63208 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SKP1P63208 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SKP1P63208 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SKP1P63208 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SKP1P63208 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SKP1P63208 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SKP1P63208 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SKP1P63208 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SKP1P63208 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SKP1P63208 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SKP1P63208 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SKP1P63208 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SKP1P63208 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SKP1P63208 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SKP1P63208 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SKP1P63208 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SKP1P63208 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SKP1P63208 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SKP1P63208 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SKP1P63208 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SKP1P63208 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms