Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 SDHD-214ENST00000614349 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 ZNF33A-205ENST00000469037 1530 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 AC011239.2-201ENST00000624820 1489 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 AL359878.1-201ENST00000381466 1886 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 SNORA30.1-201ENST00000363193 129 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 AC104117.4-201ENST00000521486 847 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 AC068858.1-201ENST00000525114 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 AC027682.3-201ENST00000564717 207 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 CDK7-201ENST00000256443 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 AP000787.1-205ENST00000536683 1485 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 THEG-204ENST00000530711 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 BX510359.7-201ENST00000619819 630 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 FAM126A-201ENST00000409763 616 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 NOS2P3-201ENST00000411468 867 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 NOS2P2-201ENST00000426269 867 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 CCDC42-202ENST00000539522 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 AC063977.2-201ENST00000601996 421 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 SLC36A1-211ENST00000616007 1389 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 BBOX1-AS1-203ENST00000530430 879 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 BBOX1-AS1-204ENST00000531363 745 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCA4P51532 FANK1-203ENST00000368693 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms