Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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HOXD10P28358 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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HOXD10P28358 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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HOXD10P28358 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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