Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 HNRNPA1P73-201ENST00000446472 928 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AL078624.1-201ENST00000604004 547 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AL031577.1-201ENST00000339867 399 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 RN7SL22P-201ENST00000471800 269 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AC005519.2-201ENST00000554532 1367 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AC104117.4-201ENST00000521486 847 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AC104759.1-201ENST00000559109 939 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AL353581.1-201ENST00000606916 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2AP24928 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms