Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 ZC3H8-201ENST00000272570 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI3P10071 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI3P10071 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI3P10071 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI3P10071 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI3P10071 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI3P10071 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI3P10071 FANK1-203ENST00000368693 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI3P10071 SOD1-202ENST00000389995 865 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI3P10071 FTLP3-201ENST00000427242 528 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI3P10071 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI3P10071 ROPN1L-AS1-201ENST00000513037 189 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI3P10071 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI3P10071 SMIM22-207ENST00000589721 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI3P10071 PILRB-213ENST00000609309 993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI3P10071 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI3P10071 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI3P10071 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI3P10071 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI3P10071 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 HRASLS2-201ENST00000255695 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 C9orf24-202ENST00000379124 648 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 RPSAP61-201ENST00000412542 878 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 CLK2P1-201ENST00000416636 1294 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 AC105443.1-201ENST00000433754 712 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 PRDX3P2-201ENST00000447051 611 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 AL645940.1-201ENST00000606432 594 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 AL158032.2-201ENST00000616818 195 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI3P10071 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI3P10071 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI3P10071 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI3P10071 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI3P10071 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI3P10071 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI3P10071 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI3P10071 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI3P10071 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI3P10071 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI3P10071 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI3P10071 TPT1-201ENST00000309246 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI3P10071 SFTPA2-202ENST00000372327 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI3P10071 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI3P10071 POU5F1-202ENST00000441888 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI3P10071 OR52X1P-201ENST00000446117 914 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI3P10071 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI3P10071 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI3P10071 PDPN-208ENST00000509009 571 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI3P10071 GABARAPL2-203ENST00000565057 571 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI3P10071 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI3P10071 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI3P10071 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GLI3P10071 LINC00337-201ENST00000429480 1302 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GLI3P10071 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GLI3P10071 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GLI3P10071 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GLI3P10071 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI3P10071 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI3P10071 TMEM186-201ENST00000333050 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI3P10071 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI3P10071 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI3P10071 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI3P10071 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI3P10071 VPREB3-201ENST00000248948 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI3P10071 BNIP1-202ENST00000351486 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI3P10071 KRTAP12-1-201ENST00000391617 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI3P10071 VPREB3-202ENST00000398465 503 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI3P10071 AC096536.3-201ENST00000415336 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI3P10071 AL121972.2-201ENST00000431108 556 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms