Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 AC126177.4-201ENST00000547452 731 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 SOX2-OT-221ENST00000594942 675 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLA1P09884 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLA1P09884 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLA1P09884 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLA1P09884 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLA1P09884 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLA1P09884 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLA1P09884 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLA1P09884 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLA1P09884 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLA1P09884 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLA1P09884 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLA1P09884 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLA1P09884 AC245128.1-201ENST00000400864 1294 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLA1P09884 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLA1P09884 RN7SL22P-201ENST00000471800 269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POLA1P09884 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLA1P09884 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POLA1P09884 CD276-217ENST00000564751 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLA1P09884 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POLA1P09884 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLA1P09884 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLA1P09884 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLA1P09884 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLA1P09884 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLA1P09884 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLA1P09884 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLA1P09884 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLA1P09884 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLA1P09884 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLA1P09884 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
POLA1P09884 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLA1P09884 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLA1P09884 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLA1P09884 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLA1P09884 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLA1P09884 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLA1P09884 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLA1P09884 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLA1P09884 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLA1P09884 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLA1P09884 CST7-201ENST00000480798 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLA1P09884 RN7SL638P-201ENST00000494527 290 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLA1P09884 SCGB1A1-202ENST00000534397 466 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLA1P09884 AC048380.1-201ENST00000589818 465 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLA1P09884 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLA1P09884 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLA1P09884 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLA1P09884 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLA1P09884 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLA1P09884 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLA1P09884 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLA1P09884 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLA1P09884 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLA1P09884 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLA1P09884 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLA1P09884 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLA1P09884 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLA1P09884 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLA1P09884 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLA1P09884 SNORA30.1-201ENST00000363193 129 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLA1P09884 FANK1-203ENST00000368693 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLA1P09884 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLA1P09884 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLA1P09884 SPG20-AS1-203ENST00000493739 566 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLA1P09884 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLA1P09884 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLA1P09884 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLA1P09884 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLA1P09884 Z92544.2-202ENST00000566927 407 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLA1P09884 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLA1P09884 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLA1P09884 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLA1P09884 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLA1P09884 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLA1P09884 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLA1P09884 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLA1P09884 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLA1P09884 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLA1P09884 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLA1P09884 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLA1P09884 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLA1P09884 AC012158.1-201ENST00000535684 1366 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLA1P09884 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLA1P09884 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POLA1P09884 MYL3-201ENST00000292327 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLA1P09884 MB-204ENST00000401702 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLA1P09884 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLA1P09884 HTATIP2-203ENST00000443524 967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLA1P09884 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLA1P09884 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLA1P09884 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POLA1P09884 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLA1P09884 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLA1P09884 TRIML2-207ENST00000512729 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms