Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms