Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00908-202ENST00000578613 2242 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERI1-209ENST00000523898 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STRA6-201ENST00000323940 2864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHC1-210ENST00000448116 3481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2L3-204ENST00000545681 2932 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCM4-215ENST00000523944 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSF3R-204ENST00000373104 2953 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01209-201ENST00000451289 2400 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPD1-201ENST00000301149 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POM121L9P-201ENST00000414583 5018 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ILF3-219ENST00000590261 3219 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OTUD6B-201ENST00000285420 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLD5-204ENST00000442594 3305 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STRC-213ENST00000541030 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P2RX1-201ENST00000225538 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PISD-202ENST00000382151 2669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHA4-202ENST00000512229 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TXNDC2-202ENST00000357775 2830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC39A13-204ENST00000524928 3553 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNKS-213ENST00000522110 2900 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM161A-203ENST00000405894 3684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CICP19-201ENST00000632944 2357 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A13-202ENST00000416240 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008806.1-201ENST00000624962 2443 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRM8-201ENST00000339582 4057 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ESPNL-203ENST00000409506 3610 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUT1-202ENST00000308436 2826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMCR5-201ENST00000543475 2844 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MID1IP1-204ENST00000614558 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EBF2-203ENST00000520164 5145 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZKSCAN3-203ENST00000377255 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAB1-203ENST00000409641 2472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TP53I11-220ENST00000533940 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIG1-221ENST00000613670 3949 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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