Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HHLA1C9JL84 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HHLA1C9JL84 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 267.5 ms