Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 DUSP10-201ENST00000366899 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HMGB1P1B2RPK0 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms