Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
XCL2Q9UBD3 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms