Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms