Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PLVAPQ9BX97 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.4 ms