Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRACR2AQ9BSW2 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRACR2AQ9BSW2 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms