Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms