Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 TUB-202ENST00000305253 6420 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 ZNF283-209ENST00000618787 5713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 SLC6A1-201ENST00000287766 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 ATP7B-201ENST00000242839 6638 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms