Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 SPOCK3-203ENST00000421836 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 FAM156B-203ENST00000593751 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 FAM156A-201ENST00000596733 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 PPP1R26P1-201ENST00000474415 3613 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 IKZF4-203ENST00000547167 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 TMEM63B-201ENST00000259746 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 ZIC3-201ENST00000287538 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 ALOXE3-201ENST00000318227 3053 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 SZRD1-201ENST00000401088 3636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 AC091170.1-201ENST00000582983 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 AC005696.4-201ENST00000614400 3147 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3GL3Q99963 AC008758.4-201ENST00000435033 2593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms