Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 TRAP1-201ENST00000246957 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 CACNB4-201ENST00000201943 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 GZMH-201ENST00000216338 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 AL133453.1-201ENST00000554055 581 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 CPA1-207ENST00000484324 1303 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 HRASLS2-201ENST00000255695 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 POLR3DP1-201ENST00000398689 1176 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 ZNF32-AS2-201ENST00000418966 905 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 DDIAS-204ENST00000525388 961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 HNRNPA1P72-201ENST00000529511 967 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 TTC39A-AS1-201ENST00000564479 812 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 SERPINE3-203ENST00000521255 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 AL139317.2-201ENST00000556998 158 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 AC027682.3-201ENST00000564717 207 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 AC016590.1-201ENST00000588763 420 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 SLC36A1-211ENST00000616007 1389 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 RBMX2P5-201ENST00000424312 969 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 AC010551.3-201ENST00000563772 463 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 AC069061.4-201ENST00000581294 1347 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 MAL-202ENST00000349807 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 LINC01508-201ENST00000425666 1013 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 PSMB8-AS1-206ENST00000458296 958 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 AC027279.2-201ENST00000561938 793 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 NAA60-236ENST00000577013 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 790.1 ms