Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HLA-CQ95604 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms