Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP13Q92995 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP13Q92995 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms