Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SEMA6DQ8NFY4 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SEMA6DQ8NFY4 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SEMA6DQ8NFY4 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SEMA6DQ8NFY4 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SEMA6DQ8NFY4 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SEMA6DQ8NFY4 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms