Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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ZNF397Q8NF99 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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