Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APTXQ7Z2E3 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms