Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 AC139887.2-201ENST00000503571 531 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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USP34Q70CQ2 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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USP34Q70CQ2 AC010551.3-201ENST00000563772 463 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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USP34Q70CQ2 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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USP34Q70CQ2 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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USP34Q70CQ2 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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USP34Q70CQ2 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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USP34Q70CQ2 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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USP34Q70CQ2 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 METTL22-203ENST00000561758 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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USP34Q70CQ2 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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USP34Q70CQ2 ZNF32-AS2-201ENST00000418966 905 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 CNBP-202ENST00000441626 1040 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 AC008764.4-207ENST00000600705 956 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USP34Q70CQ2 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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