Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms