Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 ZNF140-202ENST00000355557 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 TP53TG5-201ENST00000372726 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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LINC01545Q5VT33 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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