Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERC4Q5GLZ8 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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