Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms