Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 OVOL1-201ENST00000335987 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 RALGDS-203ENST00000372062 3596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF502-203ENST00000436624 2314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 ORMDL2-201ENST00000243045 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 PLK4-209ENST00000513090 3123 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 GAS7-219ENST00000585266 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 SUCO-209ENST00000610051 2925 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 CTAGE13P-201ENST00000416709 2446 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 TPO-204ENST00000382198 2283 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF133-201ENST00000316358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 TGM3-201ENST00000381458 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 ABCC4-207ENST00000629385 2903 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AC000068.1-201ENST00000431090 2097 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms