Protein–RNA interactions for Protein: Q17RN3

FAM98C, Protein FAM98C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM98CQ17RN3 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 MIR181D-201ENST00000384853 137 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM98CQ17RN3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms