Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SIX1Q15475 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SIX1Q15475 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SIX1Q15475 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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