Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 SLC14A1-205ENST00000502059 2371 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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PMS2P11Q13670 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 LINC00538-201ENST00000626109 1906 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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PMS2P11Q13670 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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PMS2P11Q13670 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
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