Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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