Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PTPRJQ12913 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PTPRJQ12913 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PTPRJQ12913 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PTPRJQ12913 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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PTPRJQ12913 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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PTPRJQ12913 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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