Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms