Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 BORA-202ENST00000377815 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 DBH-202ENST00000393056 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 CLEC4F-201ENST00000272367 2475 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 C17orf80-201ENST00000255557 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 PACRG-AS1-201ENST00000626335 2192 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 GOLGA1-202ENST00000373555 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 DERL3-203ENST00000404056 3113 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 LPXN-203ENST00000528954 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 ELN-201ENST00000252034 3781 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 CACNA2D3-AS1-201ENST00000471265 2078 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 TUBGCP2-201ENST00000252936 3885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 ABCA3-201ENST00000301732 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 FER1L6-AS1-201ENST00000518567 2315 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 AKAP1-208ENST00000572557 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 PEX12-201ENST00000225873 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 AC091178.1-201ENST00000583447 2305 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 HDAC7-230ENST00000552960 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 EPHB6-202ENST00000422643 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 DQX1-201ENST00000393951 2540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 LINC01561-201ENST00000369071 2176 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 PLEKHG5-208ENST00000400915 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 DIS3-205ENST00000545453 3651 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 SOCS2-AS1-201ENST00000499137 3325 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 PHF21B-202ENST00000396103 3540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 RCBTB2-206ENST00000544904 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 ZFAT-209ENST00000520727 4686 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 SNRNP48-201ENST00000342415 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 LVRN-201ENST00000357872 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 ABR-201ENST00000291107 2673 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 LRRCC1-201ENST00000360375 3813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 CAPN1-208ENST00000527323 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 INAVA-201ENST00000367342 4298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 AL713866.1-201ENST00000563320 3125 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX1P83916 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 AGK-201ENST00000355413 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 PLA2G6-203ENST00000402064 3011 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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