Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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AP3M2P53677 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP3M2P53677 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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