Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP4P49662 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP4P49662 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP4P49662 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP4P49662 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP4P49662 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP4P49662 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP4P49662 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP4P49662 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP4P49662 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP4P49662 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP4P49662 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP4P49662 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP4P49662 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP4P49662 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP4P49662 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP4P49662 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP4P49662 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP4P49662 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP4P49662 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP4P49662 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP4P49662 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP4P49662 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP4P49662 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP4P49662 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP4P49662 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP4P49662 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP4P49662 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP4P49662 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP4P49662 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP4P49662 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP4P49662 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP4P49662 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP4P49662 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP4P49662 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP4P49662 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP4P49662 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP4P49662 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP4P49662 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP4P49662 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms