Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TNNI2P48788 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNNI2P48788 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms